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wie wir dieses Thema behandeln und wie unsere Eselsbrücken aussehen:
Pyrimidinsynthese
- Die sog. Purine und Pyrimidine sind ringförmige Basen. Da sie oft in sog. Nukleosiden und Nukleotiden vorkommen, werden sie auch Nukleobasen genannt. In diesem Meditrick geht es um die Pyrimidine: Cytosin, Thymin und Uracil.
- Sie können mit einem Zucker (oft einer Pentose) verbunden werden. Die Verbindung aus Base und Zucker nennt man Nukleosid (mit S! – wie mit "sugar"). Reminder 1: Wenn man von Pyrimidinen spricht, meint man die Nukleobasen, nicht die Nukleoside. Man kann aber von Pyrimidin-Nukleosiden sprechen. Reminder 2: Die Pyrimidin-Nukleoside heißen anders als die Pyrimidin-Basen! Sie heißen Cytidin, Uridin und Thymidin.
- Nukleoside können nun mit einem oder mehreren Phosphatresten verbunden werden. Ab dann heißen sie Pyrimidin-Nukleotide (mit T!) Je nachdem, wie viele Phosphatreste drankleben, heißen sie zum Beispiel Adenosin-Monophosphat, Diphosphat oder Triphosphat.
Basiswissen
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Grundlagen
(Beschädigte) DNA benötigt Nukleotide: Synthese im Zytosol
(Baufälliges) Rathaus benötigt Bausteine: Synthese vor Rathaus
Die DNA benötigt immer wieder frische Nukleotide, um z.B. Schäden zu reparieren.
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Grundlagen
Pyrimidinbasen: Cytosin & Thymin
Pyramidenförmige Bausteine: rote & thymianblaue Pyramiden
Vgl. Purinsynthese für die Purinbasen.
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Grundlagen
De-novo-Synthese vs. Wiederverwertung
Wegweiser mit "De Novo" u. "Recyclinghof"
Da die Synthese sehr energieaufwändig ist, werden Pyrimidine möglichst rezykliert.
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Nukleinbase-Synthese > Reaktion 1
Carbamoylphosphatsynthetase 2: drei katalytischen Zentren
Kabel-Maul-Hase mit 2 auf Jacke: drei Arme
Erst wird die Pyrimidin-Nukleinbase synthetisiert (6-Ring mit Kohlen- und Stickstoff). Synthetasen verbrauchen immer ATP (grüne Jacke).
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Nukleinbase-Synthese > Reaktion 1
Schlüsselenzym: Carbamoylphosphatsynthetase 2
Schlüssel auf Kochtopf
An diesem Schlüsselenzym findet die Regulation der Pyrimidinsynthese statt.
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Expertenwissen
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Nukleinbase-Synthese > Reaktion 3
Dihydroorotat: Ring bildet Pyrimidingrundgerüst
2-Haar-Helferlein u. Rot-Ohr-Hase: Halskette u. Pyramidengerüst
Als Nächstes wird der Ring geschlossen: aus Carbamoylaspartat entsteht Dihydroorotat. Dihydroorotat bildet das Pyrimidingrundgerüst.
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Nukleinbase-Synthese > Reaktion 3
Dihydroorotat: entsteht durch Dehydratisierung
Kleiner Hase mit roten Ohren und 2-Haar-Helferlein: spuckt
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Umwandlung zu Nukleotid > Reaktion 4
Dihydroorotat-Dehydrogenase: innere Mitochondrienmembran
Dehydrator: auf doppeltem Maschendrahtzaun des Kraftwerkviertels
Die Dihydroorotat-Dehydrogenase befindet sich als einziges Enzym der Pyrimidinnukleotid-Synthese in der inneren Mitochondrienmembran. Alle anderen befinden sich im Zytosol.
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Gereift unter der Sonne Freiburgs. mit viel Liebe zum Detail ersonnen, illustriert und vertont. Wir übernehmen keine Haftung für nicht mehr löschbare Erinnerungen.
